Kommer en på din controller type og software.
Jeg har en Fasttrak100 fra Promise som man kan sætte op på mange forskellige måder - bl.a. den som du ønsker.
Fasttrack 100 er et controller kort o.d.v.s. at jeg endvidere også har den mulighed at sætte ekstra harddisk direkte til bundkortet.
Som du skriver har du raid controller og jeg vil mene, at det ikke er noget problem.
Hvis du vælger at tilslutte ekstra harddisk til bundkortet (uden om Controller) så tjek lige i Bios om hvor systemet booter fra.
Jeg har bl.a. en PC med Windows XP med Fasttrack100 og kan bruge begge måder (virkede også med Windows ME) - så det burde også virke hos dig.
Mvh
Bjarne